水源場所：曽根沼流入場所：彦根市三津屋町
水質等 ：荒神山のふもとにある曽根沼から流れ出る
文録川／一級河川（ぶんろく）
水源場所：彦根市野良田町流入場所：湖岸緑地 薩摩
水質等 ：彦根市検査／宇曽川と愛知川の伏流水
第３次支川（一級）：額戸川
室戸川／一級河川（むろと）
水源場所：彦根市薩摩町田園地帯流入場所：湖岸緑地 薩摩
水質等 ：流れはなく 水は澱んでいる 湖岸に大川・石川・今川などの小さな川がある
不飲川／一級河川（のまず）
水源場所：愛知郡愛荘町流入場所：湖岸緑地 柳川漁港
水質等 ：彦根市検査／水源としている不飲池で平将門の首を洗ったところ血で濁り飲めなくなったという言い伝えがある（野間津池）
愛知川／一級河川（えち）
水源場所：東近江市茨川町 鈴鹿山脈流入場所：愛知川緑地 彦根市と東近江市の境
水質等 ：東近江市検査 県環境基準設定河川／鈴鹿山脈の御池岳に発し永源寺ダムを含み大きな扇状地を形成する 彦根市と東近江市の境界を琵琶湖へ注ぐ 上流から中流の東近江市にかけて国道421号（八風街道）が並行する（愛知川に黄和田発電所・永源寺発電所を第３次支川神崎川に神崎川発電所を有す） あゆ釣り等ができる河川（愛知川漁業協同組合）（愛知川上流漁業協同組合・御池川・茶屋川・神崎川）
第３次支川（一級）：大同川放水路 加領川 千手川 和南川 渋川 御池川 神崎川 八風川
第４次支川（一級）：（加領川）経田川 （和南川）平成川 井の谷川
第５次支川（一級）：（経田川）豊国川 棚上川