水源場所：長浜市宮司町流入場所：長浜高校 稲荷神社の南
水質等 ：水路状で流れも殆どない 北隣の「良疇寺」には大きな琵琶湖大仏が目に止まります
長浜新川／一級河川（ながはましんせん）
水源場所：長浜市川崎町流入場所：長浜市下坂浜町
水質等 ：長浜市検査／市内を流れる薬師堂川 十一川 米川等の河川の洪水を上流部でカットし琵琶湖に放流する新たな河川（放水路）下流部分では魚や鳥 ホタルが生息するなど徐々に新たな自然環境が育まれ貴重な自然空間となっている
第３次支川（一級）：薬師堂川 山路川
五井戸川／準用河川（ごいど）
水源場所：長浜市石田町流入場所：湖岸緑地さいかち浜 湖周道路五井戸橋下
水質等 ：長浜市検査／田園地帯を流れ比較的水量もある 源流部は石田三成出生地
深町川／ 一級河川（ふかまち）
水源場所：米原市長沢流入場所：長浜バイオ大学南 長浜市との境
水質等 ：田園地帯を流れる 流れはない
土川／一級河川（つち）
水源場所：長浜市常喜町熊岡神社東山中流入場所：神明キャンプ場南
水質等 ：長浜市検査・米原市検査／水量も豊富で流れもある
第３次支川（一級）：前川